É o mesmo que acontece quando alguém demole a tua fazenda, enquanto as tropas estão fora da aldeia...
Digamos, tens fazenda nível 25 full, e estás atacando outro jogador... Nisso, algum outro jogador(ou o mesmo que estás atacando) te ataca, e diminui 5 níveis da tua fazenda...
As tuas tropas continuarão, mesmo excedendo a população do nível 20 da fazenda. Só que não poderás mais construir nenhum edifício além da fazenda e do armazém(que são os edifícios que não usam nada de população), nem tropas, até que a fazenda ultrapasse o nível 25 novamente...
No caso da Academia, se estás falando do mundo mais recente(37), pra poder fazer mais um nobre, vais ter de fazer 2 upar 2 níveis da academia, antes de fazer um novo nobre!
Espero ter ajudado! ^o)